مصنوعات

جینوم وائڈ کرومیٹن امیونوپریسیپیٹیشن (ChIP) مطالعات نے کرومیٹن سے وابستہ پروٹینوں اور ہسٹون میں ترمیم کے جینومک لوکلائزیشن میں اہم بصیرت حاصل کی ہے۔تاہم، ان تجزیوں سے پیدا ہونے والے اعداد و شمار کی بڑی مقدار میں ایسے طریقوں کی ضرورت ہوتی ہے جو حیاتیاتی مطابقت کی تیز رفتار توثیق اور تجزیہ کو قابل بناتے ہیں۔مزید برآں، ابھی بھی پروٹین اور ترمیم کے اہداف موجود ہیں جن کا معیاری ChIP طریقوں کا استعمال کرتے ہوئے پتہ لگانا مشکل ہے۔ان مسائل کو حل کرنے کے لیے، ہم نے فوری طور پر کرومیٹن امیونوپریسیپیٹیشن کا طریقہ کار تیار کیا جسے ہم ZipChip کہتے ہیں۔ZipChip وقت کو نمایاں طور پر کم کرتا ہے اور حساسیت کو بڑھاتا ہے جس سے ایک سے زیادہ لوکی کی تیزی سے اسکریننگ ہوتی ہے۔یہاں ہم بیان کرتے ہیں کہ کس طرح ZipChIP ہسٹون ترمیمات (H3K4 mono- اور trimethylation) اور دو خمیر ہسٹون ڈیمیتھیلیسس، Jhd2 اور Rph1 کی کھوج کے قابل بناتا ہے، جن کا پہلے معیاری طریقوں سے پتہ لگانا مشکل تھا۔مزید برآں، ہم عربیڈوپسس تھالیانا میں یوکرومیٹن میں خمیر میں ہیٹروکرومیٹن پر ہسٹون ڈیسیٹ یلاز سر2 کی افزودگی اور کرومیٹن ریموڈلر، PICKLE کی افزودگی کا تجزیہ کرکے ZipChIP کی استعداد کا مظاہرہ کرتے ہیں۔