مصنوعات

ہم نے حال ہی میں اطلاع دی ہے کہ پائرین نیوکلیوٹائڈ ترجیحی طور پر ایک اباسک سائٹ کے برعکس ڈالا جاتا ہے، تھامین ڈائمر کا 3'-T، اور خمیر DNA پولیمریز ایٹا (پول ایٹا) کے ذریعہ سب سے زیادہ غیر نقصان شدہ اڈے۔چونکہ پائرین ایک غیر قطبی مالیکیول ہے جس میں H-بانڈنگ کی صلاحیت نہیں ہے، اس لیے dPMP داخل کرنے کی غیر معمولی طور پر اعلی افادیت اس کی اعلیٰ بیس اسٹیکنگ کی قابلیت سے منسوب ہے، اور پول ایٹا کے ذریعہ نیوکلیوٹائڈس کے انتخاب میں بیس اسٹیکنگ کی اہمیت کو واضح کرتی ہے۔پول ایٹا کے ذریعہ نیوکلیوٹائڈس کے انتخاب میں ایچ بانڈنگ اور بیس پیئر جیومیٹری کے کردار کی چھان بین کرنے کے لیے، ہم نے بیس میں ترمیم شدہ نیوکلیوٹائڈس 2,6-ڈامینوپورین، 2-امینوپورین، 6-کلوروپورین، اور انوسین کے اندراج کی افادیت کا تعین کیا۔ بیس پیئر جیومیٹری کے لحاظ سے ٹیمپلیٹ بیس کے ساتھ H-بانڈز کی مختلف تعداد بنائیں۔واٹسن-کرک بیس جوڑی C اور T کے مخالف اندراج کے لیے نیوکلیوٹائڈ اینالاگز کے انتخاب میں اہم کردار ادا کرتی دکھائی دیتی ہے جیسا کہ واٹسن-کرک H-بانڈز کی تعداد میں کمی اور اضافہ کے ساتھ رشتہ دار اندراج کی افادیت میں کمی سے ظاہر ہوتا ہے۔ عطیہ دہندہ اور قبول کنندہ قبول کرنے والے تعاملات کی تعداد۔نیوکلیوٹائڈ داخل کرنے کی سلیکٹیوٹی تھامین ڈائمر کے 3'-T کے مقابلے 5'-T کے برعکس زیادہ ہے، پچھلے کام کے مطابق یہ تجویز کرتا ہے کہ 5'-T کو 3'-T سے زیادہ سختی سے رکھا گیا ہے۔مزید برآں، ڈائمر کے دونوں Ts کے مخالف A کا اندراج واٹسن-کرک بیس پیئرنگ کے ذریعے ثالثی کرتا ہوا دکھائی دیتا ہے نہ کہ A اور 7-deaza-A کی تقریباً یکساں اندراج کی افادیت کی بنیاد پر Hoogsteen بیس پیئرنگ کے ذریعے، جس کے بعد میں H- کی کمی ہے۔ N7 پر بانڈنگ کی صلاحیت۔نیوکلیوٹائڈس کے اندراج کے لیے متعلقہ افادیت جو واٹسن-کرک بیس جوڑے بنا سکتے ہیں وہ کلینو فریگمنٹ کے متوازی ہیں، جب کہ کلینو کا ٹکڑا اپنی زیادہ شکل کی سلیکٹیوٹی کے مطابق، مماثلت کے خلاف زیادہ سختی سے امتیاز کرتا ہے۔یہ نتائج پول ایٹا اور کلین اوو فریگمنٹ دونوں کے ذریعہ نیوکلیوٹائڈس کے انتخاب میں ایچ-بانڈنگ اور واٹسن-کرک بیس پیئر جیومیٹری کی اہمیت کو اجاگر کرتے ہیں، اور پول ایٹا کے اندراج میں شکل کے انتخاب کے کم کردار کی وجہ سے اس کے زیادہ کھلے اور کم ہوتے ہیں۔ محدود فعال سائٹ.